Perfeito, muito obrigado pela resposta. Ajudou bastante meu caro amigo
agora...pensando por outro lado, em teoria vc consegue montar:
/var/www/site.com.br/public/
as pasta internas do framework coloque em /var/www/site.com.br/ (que é acima da raiz do site)
e em
/var/www/site.com.br/public/crm <arquivos publicos do seu framework, normalmente o index.php e assets js e css>
ai é o caso de ajuster no index.php do seu framework para ao invés de carregar dependencias um nivel pra cima, subir 2 níveis.
talvez funcione, embora ainda manteria separado em outro subdomínio e simplesmente redirecionaria site.com.br/crm para crm.site.com.br
O problema é que o sistema possuí 2 index, uma é do wordpress e a outra é dos arquivos criados para serem integrado. O sistema em wordpress é uma landing page, e o sistema criado para integração é um crm, acredito que no caso do subdominio igual você informou já resolveria, não?