Seu argumento é ótimo, a questão então é encontrar maneiras que permitam ao usuário ter liberdade de fazer qualquer coisa com o que lhe pertence.
Mantendo o contexto do exemplo: e se a Apple cria um padrão para que se trabalhe temas e para personalizar o iOS é preciso aderir ao padrão? Dá liberdade para o usuário sem sacrificar desempenho.
É uma forma... Por exemplo: já passou da hora da Apple permitir que o usuário customize as "Faces" do Apple Watch como quiser, ao invés de ter que contar com a meia dúzia que eles disponibilizam apenas. Imagino que deveria ser algo super simples de implementarem, mas não o fazem. Então assim, eu tenho as minhas críticas à Apple, e são muitas, mas existem algumas coisas que os usuários pedem que eu particularmente não concordo por N motivos. Essa do sideloading pode até rolar, mas eu espero que a Apple faça do jeito certo sem cortar caminhos, e que use quem quiser, mas não é a minha intenção.
GrazaDeus existe Android e a opção de personalizar absolutamente tudo, especialmente hoje em dia em que a personalização não tem um custo expressivo em termos de recursos computacionais.
Nesse caso eu sou a favor do livre mercado: a Apple é livre para não deixar fazer qualquer coisa e o consumidor tem que ser livre para escolher outro produto ou serviço que atenda às suas necessidades e vontades.