Esse que você linkou provavelmente tem algunas dezenas ou centenas de milhares de reais investidos em todo o processo: estrutura corporativa, time de desenvolvimento, time de suporte, marketing, hospedagens e etc.
Emissão de notas fiscais não é algo simples, existem algumas variações: venda, revenda, devolução, serviços... estadual, interestadual... contigências... Além de ter que lidar com os SEFAZ de cada um dos estados, e no caso de serviços, cada uma das prefeituras.
Então Matheus, para poder "precificar" algo tão complexo quanto isso, seria melhor ter mais informações do escopo do projeto. Mas eu cobraria uma boa grana.