Acho a abordagem de cálculo por horas uma métrica interessante para projetos, o que pressupõe escopo e prazo definidos, porque desta forma você incluir na estimativa a complexidade do projeto, algo que em Pontos de Função não funciona bem. Pontos de Função são ótimos quanto há muitas CRUDs, por exemplo. Imagine o caso de uma inteface gráfica extremamente complexa que praticamente não consome ou modifica dados ou talvez regras de negócio intricadas.
A métrica Pontos de Especificação por Exemplo – PEEX, por exemplo, tenta equilibrar as distorções que ocorrem em Pontos de Função.