Vejo que ambas modalidades possuem suas vantagens e desvantagens, cabendo a cada pessoa analisar o melhor modelo para o momento atual de sua vida.
Por exemplo, ainda não trabalho com tecnologia, estou buscando a transição para uma posição de desenvolvedor. Por ainda estar engatinhando como programador, vejo um risco consideravel em iniciar direto com um contrato PJ, preferindo a CLT. Porém no futuro, quando estiver com a carreira mais "estável", espero migrar para o PJ visando uma maior remuneração juntamente com a flexibilidade possivel nos contratos de pessoa jurídica.