E aqui vc tem vários caminhos em relação a qual Pos Graduação fazer. Pode ser a de Eng Software, pode ser algo voltado a algoritmos, etc. Uma infinidade de opções. Além disso, você pode estudar de forma auto didática alguns assuntos de Ciência da Computação que você queria ter aprendido.

Para o mercado, o curso em si não importa. Geralmente dão mais relevância se tem ou não graduação/pós graduação (indiferente de qual foi).

E para você como profissional, não fique para trás porque não aprendeu assunto X ou Y pq é assunto de outro curso. No GitHub tem muitos conteúdos livres a respeito de ciência da computação que inclusive eu as vezes uso para revisar.

Eu fiz ciência da computação, me lasquei todo, mas gostei bastante do que aprendi no curso.