De fato é melhor que o Electron em vários pontos. Mas é pior em alguns. As tecnologias web não são lá muito estáveis. Ou seja, mudam alguma coisa no renderizador e seu aplciação pode sofrer. Por isso criuaram o Electron, não muda sem você saber, e essa á uma enorme vantagem que não pode ser desprezada. O prohlema é que ambos tentam dar solução para um problema que nem deveria existir.
Tem várias soluções que usam webview, algumas nem precisam de dependências extras, ainda que isso tenha sua desvantagem também, já que teria que cuidar de várias coisas que não vem prontas.
Porém, no final de tudo ainda é uma aplicação web se fingindo de desktop tirando várias das vantagens da plicação desktop.
WebGPU pode fazer algum sentido, mas eu não tenho informações suficientes ainda. A a questão é que WebGPU não é web, até onde eu sei. Seria uma solução universal que criram para web mas que serve para resolver um problema que desktop também tem. Um dia poderei falar mais disso, inclusive se implementaram tuo certo e vão conseguir fazer funcionar sem depender de nada web, como parece poder.