Só pra complementar, já expliquei aqui - e em mais detalhes aqui - como o Tiobe calcula o seu ranking. Leia e entenda porque ele não deve ser levado tão a sério.

Sobre PHP ser usado por 78% da web (ou qualquer outra porcentagem, varia conforme a fonte), provavelmente foi por causa do w3techs. Mas no próprio site deles é dito que a metodologia não garante que eles detectam com 100% de certeza a tecnologia usada por determinado site, além de não visitar toda a web (eles só consideram o que chamam de "relevant web"). Para saber mais, veja o FAQ deles, em especial aqui e aqui.