O problema na verdade não é o fato de elas não funcionarem ou algo do tipo, mas que você, como desenvolvedor, nunca terá o controle do seu próprio produto. Eu concordo que é incrível utilizar ferramentas de no/low-code para fazer MVPs, mas você não pode ficar preso apenas em uma prova de conceito.
Na maioria dessas ferramentas para iniciar um desenvolvimento realmente bem feito é necessário praticamente refazer tudo do 0. Se para coisas simples como páginas web elas já fazem tudo mal feito, imagine para sistemas de backend, onde deve-se ter muito mais atenção.
Hoje em dia a maioria das ferramentas no/low-code se limitam apenas a criar rapidamente Provas de Conceito, existem excessões, como o WordPress, mas mesmo as excessões podem ser facilmente substituídas por um bom desenvolvedor.