Além dos pontos levantados, acredito que antes de partir para a escolha da ferramenta é necessário compreender os requisitos de negócios. Por exemplo, precisa de split de pagamento?
Trabalho com a Pagarme porque faz o split com vários sellers/vendedores e é possível realizar retentativa de pagamento com uma transação de pagamento por cartão de crédito.
No resumo cada ferramenta irá resolver um conjunto de problemas e o importante é vocês compreender quais problemas o seu sistema precisa resolver.