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Como você está fazendo o clone? Está usando algum software ou a própria gaveta está clonando?
Tenta gerar uma ISO do SO, tem bons softwares que eu uso, como Systemback, Refracta ou PenguinEggs.
Gera uma ISO e manda instalar nesse HD.

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Eu estava fazendo a imagem pelo clonezilla.
Fiz exatamente isso, baixei o ISO do SO e instalei na máquina e coloquei um timer de energia para simular quedas de energia, afim de fazer testes se a máquina vai continuar dando erro.