Cara, minha dica com certeza vai ser o terror dos médicos, então por favor não endeusem tudo que eu falar aqui.

Sim, é importante fazer um acompanhamento com um oftalmo, utilizar óculos com proteção de luz azul adequado, e também programar a famosa pausa de 15 minutinhos e ir bater um papo com uma planta ou outra coisa aleatória em sua casa ou trabalho, para não ficar 100% preso a uma tela, e claro SEM CELULAR!
É bom mapear também coisas que desencadeam suas enxaquecas para evitar, como vício em café e outros itens do tipo.

Mas, infelizmente mesmo nos cuidando, sempre corremos esses riscos, e a dica chave é o costume. Sim, você vai se acostumar com longos períodos nas telas, com o cansaço da vista e no meu caso até mesmo com as enxaquecas, elas vão continuar te incomodando, mas você vai aprender a lidar com ela quando atacar. Tenha sempre uma cartelinha de Dorflex Uno por perto.
Mas, não aceite simplesmente a dor apesar do costume, continue procurando um oftalmo e tratando da melhor forma possível com um profissional. E a dica master: tome bastante água pra evitar desencadear dores.