Dei uma olhada por cima nas respostas para ver mais ou menos o que o pessoal falou.
Acho que antes de qualquer coisa, qual é a necessidade que você encontrou para ter um MEI ou um CNPJ (que geralmente é o principal objetivo de alguém querer abrir um cadastro de MEI).
Você não precisa ser MEI para prestar serviços.
Caso esse time que está te contratando tenha interesse em te pagar de formalmente, basta que eles façam um R.P.A. (Recibo de Pagamento à Autônomo) com isso, é possível recolher todos os impostos devidos (INSS e IRRF - se aplicável).
Caso optem por essa saída, você e eles precisarão declarar o pagamento/recebimento na DIRPF/DIRPJ.
Com MEI, você vai ter uma série de outras obrigações inerentes, como emissão de Nota Fiscal, declaração de rendimentos, pagamento mensal de DAS e declaração anual de IRPJ.
Sinceramente, não vejo os benefícios de se abrir um MEI.