Você pode utilizar o Stripe, é muito bom. Tem suporte para fazer repartição do valor recebido para outras contas (Pode dar % do valor pra quem vendeu aquele produto pra você, comissao)
Tem integração com micro serviços, por algum sistema de mensageria.
Tem suporte pra assinaturas recorrentes também

Como vi nos comentários quer integrar o pix, se não me engano o stripe não possui suporte pois o pix é brasileiro, pra isso você pode usar uma biblioteca no NPM chamada qrcode-pix não cheguei a utilizar mas existem alguns downloads e parece ser promissor.

PayPal, não recomendo pois as taxas são bem altas e você perde um bom valor

MercadoPago é bem interessante, nunca tive problemas e utilizo a uns 6 anos (Infelizmente você teve problema :/)

PagSeguro, fiz somente uma integração a muito tempo e não curti. Por opção própria não uso. Mas pode ser interessante pra você também.