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É um banco de dados de CNPJ + CPF + NOME.
O banco de dados é MySQL.

Eu não sabia que dava para dividir o banco de dados, 68gb é muito pra dividir.
Tenho um outro, 10gb tem algum meio de deixar ele online de graça?

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Com PostgreSQL da para particionar tabelas, mas tendo índices bem criados já resolve também.
Tenho uma base de CNPJ no PostgreSQL tbm e no Firebird 5.0, são enormes e com a estrutura e índices corretos já ficam rápidoa.

O que eu posso te indicar é ter o mínimo de relacionamentos possíveis, joins com muitos registros assim fica lento.
Se quiser compartilhar acesso ou estrutura da base, podemos te ajudar