Em resumo fluídez (gestos, transições nativas, animações complexas, 60 fps, etc) e acesso a API nativa do dispositivo.

Realmente 60FPS só no desktop mesmo!
https://calibreapp.com/blog/investigate-animation-performance-with-devtools

Dependendo do dispotivo animações nunca vão chegar em 60fps
Embora chrome tenha aceleração por hardware
https://developer.chrome.com/blog/hardware-accelerated-animations/
Nem sei como é isso no Safari!

OSB: Não sou contra a ideia!
Só não vi e pra isso peço ajuda no que um app nativo seria melhor que um PWA para o tabnews. Quais apis nativas o tabnews precisa que é impossivel ficar sem?

Vamos deixar bem claro, estou falando do Tabnews.
Um app nativo acrescentaria o que ao tabnews? Features e tal!

Para outros projetos PWA pode não ser a solução!

Um app que só acessa APIs para mostrar dados
como um navegador, eu não vejo vantagem em um app nativo
hoje em dia. A não ser que precise de APIs nativas! Ai não tem espatória rsrsrs!