A biblioteca de geração de qrcode que eu uso já permite que eu troque as cores sem que eu necessariamente use um SVG, porém não achei necessário no momento da criação pensar em costumização, mas é uma boa feature a se pensar. Obrigado!
Respondendo a "eu diria pra usar svg, que dai o app pode trata..." dentro da publicação Pitch: Vos apresento: PixJS!! Uma biblioteca para gerar códigos pix copia e cola.
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