Interessante, eu particularmente as vezes tenho alguns problemas com o GitHub, mas não tem versão Linux pelo que entendi, sabe se funciona bem com o Wine?
Em resposta a Git sem nenhum código!
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Pelo que sei, o github realmente não tem uma versão do github desktop para Linux. Porém, o Brendan Forster desenvolveu e publicou uma versão para Linux.
Repositório do Github Desktop para Linux
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Opa! Muito legal o projeto, vou dar uma olhada depois, vlw