Segue o link do meu Post sobre como fazer com o painel da YunoHost em sua VPS:
Respondendo a "Sabe se tem Como adicionar em vps tbn?" dentro da publicação Como deixar seu site seguro de graça com o Let’s Encrypt SSL do Cpanel?
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Segue o link do meu Post sobre como fazer com o painel da YunoHost em sua VPS: