Sou formado em SI na USP, trabalho com TI há uns 8 anos e consigo te ajudar nessa.

Divido minha resposta nos 3 pontos abaixo e deixo minha visão no final do texto:
1 - Diferenças entre os 2 cursos pensando no futuro da carreira;
2 - Possibilidade de trabalhar em vista da carga horária;
3 - Mercado exterior;

1 - Sinceramente, esse ponto que você comentou sobre um ser mais voltado para a academia e outro para gestão (vou considerar mercado) é algo que eu também acreditava antes de entrar na faculdade, mas depois você percebe que não tem muito isso não. Na verdade, o que dita se vai ser mais acadêmico ou mais mercado, é você. Você pode fazer iniciação científica, TCC (No meu caso era possível substituir com 1 ano de estágio), mestrado, doutorado e voltar sua graduação/carreira para essa vertente, porém você pode não fazer nada disso, estagiar e fazer cursos por fora mais voltados para o mercado enquanto faz sua graduação. Isso depende de você! Assim como depende de você o quão proveitosa será a faculdade, pois você percebe que existem várias matérias na faculdade que são possíveis passar sem aprender de fato. O quanto você se dedicará para realmente aprender, independentemente de notas, e o quanto se envolverá em atividades extracurriculares que definirá o quanto, de fato, você aprenderá.

2 - Com estudo em tempo integral torna-se MUITO difícil trabalhar. O máximo que você conseguiria seria um estágio ou trabalhar como freelancer, mas é praticamente certo que algo vai falhar, pois além do tempo integral do curso, você teria que conciliar emprego, estudos para suas provas e ainda os trabalhos de faculdade que não costumam ser tão simples. Você pode até conseguir, mas seria aos trancos e barrancos e o seu tempo para lazer e vida social seriam praticamente nulos.

3 - Até onde eu sei não faz muita diferença, até porque lá fora, mais que aqui, pelo que pude perceber, eles levam muito mais em conta se você tem as habilidades necessárias para desempenhar a função do que um diploma. Isso que eu falo é se tratando de Estados Unidos. É algo meio que cultural deles de enaltecer o trabalho mesmo que sem ter feito qualquer graduação. Europa sei que o povo é mais tranquilão em relação ao trabalho (menos workaholic), mas não sei se tem impacto um curso ou outro, mas eu diria que não (é uma característica de TI num geral não se prender tanto a graduação, muito menos se CC ou SI).

Minha sugestão:
Você comentou que ainda não sabe qual é o seu perfil (acadêmico ou mercado), eu acredito que independentemente disso, para TI, valha a pena seguir em um curso que não seja de tempo integral. Se chegar lá no final do curso e você ver que na verdade você prefere seguir uma carreira acadêmica, basta você fazer seu TCC e já ir encaminhando uma vaga no mestrado.

Até la, você já vai ter tido a oportunidade de estagiar (hoje em dia tem várias vagas home office e ficou mais tranquilo trabalhar para quem não mora perto de empresas que tenham vagas de tecnologia) e ter mais maturidade para decidir o seu rumo. Se decidir que vai seguir carreira no mercado, já fica mais fácil ser efetivado na empresa (conseguir uma vaga direto de junior é mais difícil, pois muitas empresas exigem experiência e uma enormidade de tecnologias e habilidades que são necessárias no emprego, mas não são ensinadas na faculdade).
Se você tiver que se sustentar financeiramente então, não tem nem o que pensar. Você até pode ganhar uma certa quantia com iniciação cientifica (pelo menos na minha época tinha uma remuneração), mas é pouco, praticamente insuficiente para sobreviver e um estágio paga melhor.