Olá Tiago,

Ajudou sim.
Pelo que percebi estás a usar não só para migrar, mas também como controle de versões do schema/database ?
Sou administrador de bancos de dados, Oracle e Mysql e existe uma ferramenta chamada liquibase que faz controle de versões de schema. Não sei se conheces, nem sei se faz sentido para o que estás a tentar fazer.

Abraço,
Rui Rodrigues