Boa noite thalinzz, tudo blz? Programar é o nosso dever.
Bom, quanto as suas dúvidas, seria interessante organizar seus exercícios da seguinte forma: Crie um repositório no github tipo: RepositorioExercicios. dentro desse repositório você organiza os projetos por pasta, ex, pasta1, pasta2,etc.
Se for projeto de portfólio crie repositório individualmente para cada projeto para ficar mais organizado.
Quero também reforçar com você o conceito sobre git e github. O git é uma ferramenta de versionamento de código, enquanto o github é um local de armazenamento de código. É bom ficar ligado com isso aí pra não atrapalhar a progressão nos estudos.
Qualquer dúvida eu estou a disposição.

Abraços.