Primeiramente achei a solução muito boa, então parabéns. Agora uma pequena correção.

Nessa linha recomendo mudar a arbodagem. Ao invés do código orignal, como está abaixo

    return (item === null ? "" : item.toString().includes(event.target.value.toString()));

Utilizar essa implementação

    return (item === null ? "" : item.toString() === event.target.value.toString());

Explico o motivo da mudança. O .include() vai verificar se determinado valor existe em um array, nesse caso digamos que a gente tivesse o seguinte array

    const array = [
        {
            nome: "Nathally",
            idade: 21
        },
        {
            nome: "Nathalia",
            idade: 23
        },
        {
            nome: "Nath",
            idade: 35
        }
    ]

Neste caso, se você usar o código original e buscar somente por "Nath" ele retornará os 3 elementos, pois vai considerar que a string "Nath" existe na propriedade nome dos 3 objetos, o que é verdade. Então para evitar esse "erro", boto entre aspas pois não entendi se esse comportamento é esperado ou não, com a sugestão de correção ele retornará apenas o elemento que de fato apresenta a propriedade nome com o valor "Nath".

O código final sugerido fica assim

    const Filter = (event) => {

        return arr.filter(obj => {

            return Object.values(obj).map(item => {

                  return (item === null ? "" : item.toString() === event.target.value.toString());

            }).includes(true);

        });

    }

Espero que ajude :)