De maneira resumida, por vezes elas podem omitir detalhes importantes e/ou chegar a conclusões erradas, que não condizem com o texto original.
Concordo que nem sempre a gente precisa ler 100% de tudo, mas depender só de versões resumidas também é perigoso porque vc acaba nunca se aprofundando em nada.
Isso me lembra da época do colégio: ler o resumo do livro podia ser suficiente pra passar na prova, mas ler o livro todo te dá a experiência completa de entender todas as nuances e detalhes da história.
Claro que nem todo texto é profundo, muitos têm tanta encheção de linguiça que uma ferramenta que remova a parte irrelevante é muito bem vinda. Só fica o alerta, pra não confiar cegamente nas ferramentas. Usando com moderação e sabendo das limitações - e de vez em quando lendo o texto inteiro - não tem problema nenhum :-)