Estava neste mesmo problema há um tempo. Eu utilizava o notion para tudo, organizar a vida pessoal e profissional, e demorei um pouco para realmente entender o funcionamento do notion e conseguir resolver meu problemas de organização com ele, mas sempre me sentia limitado a isso, principalmente a possibilidade de linkar notas. Da fui para o obsidian, onde a principal vantagem e vc poder linkar notas e criar os grafos. Mas achei muito superficial a proposta do obsidian em relação aos concorrentes.
Solução
E melhor ferramenta que junta o melhor dos dois mundos, linkar notas e fazer algo próximo do notion é Capacities. Essa ferramenta me surpreendeu em todos o sentidos e nela hj que guardo as minhas notas pessoais e também é ótimo como segundo cérebro. Única desvantagem, por ser uma ferramenta "nova" e que não tem tanto conteúdo Br ensinando a usar mas na gringa tem bastante, além da ótima documentação deles.