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Você não comentou se vai abrir ME ou MEI, se for MEI, realmente não tem um CNAE específico para desenvolvedor, mas conheço PJs MEI que utilizam o 9511-8/00 | REPARAÇÃO E MANUTENÇÃO DE COMPUTADORES E DE EQUIPAMENTOS PERIFÉRICOS.

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O MEI tem atualmente um teto anual de +/- R$ 81,000.00 de faturamento. Então precisas levar isso em conta, se vais ter uma receita anual menor que esse valor, podes abrir MEI, mas se caso o montante for maior. Vais precisar entrar no ME.

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Se for abrir como MEI pode usar também o CNAE 8599-6/03 - TREINAMENTO EM INFORMÁTICA ( PARA MEI A DESCRIÇÃO É INSTRUTOR(A) DE INFORMÁTICA INDEPENDENTE )

EDIT
A verdade é que se for abrir como ME vai pagar mais imposto então, se possível, abra como MEI, opere assim no primeiro ano, e se decidir mudar de porte depois pelo menos já tem o CNPJ e economizou uma grana com a abertura.