Estou usando um projeto que não foi listado aqui, o Affine https://affine.pro/. É um projeto open source, e permite a possibilidade de um self-hosted na nuvem. Gostei muito da organização, da forma de ir adicionando os documentos, tags e de ter um Whiteboard sem fim. Dá para misturar documento com desenho em duas visualizações diferentes. Estou armazenando pensamentos, links, resumos de livros, anotações de aula, tudo aí, e de graça.

O único contra é que ainda não tem um app para o celular.