Vejo muito a galera de fora usando o Stripe. Não sei se é a melhor opção. Com a API dela você consegue receber pagamentos, fazer repasses e gerenciar pagamentos recorrentes. Além de ter outros serviços mais complexos, como o cartão corporativo.

E outra, ela tem um serviço chamado Atlas que segundo o Stripe: promete transforma a sua ideia em uma startup.