Eu estou lendo um livro que se chama Segundo Cérebro que fala justamente disso, de você sempre ter ferramentas que vão te auxiliar a anotar tudo o que você realmente precisa (fazer um filtro antes), se realmente isso vai te ajudar ou não.
Confesso que no começo eu anotava tudo o que vinha em minha mente, se fosse relacionado a estudo então... agora com o passar do tempo já consigo filtrar mais as anotações, meu fluxo de trabalho e a minha rotina de estudos melhoraram muito.
Caso queiram vou deixar o link do livro: Segundo Cérebro - Tiago Forte.