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Você pode usar direnv com um script .envrc usando source_env_if_exists /home/user/.envrc.local que somente busque as credencias em outro diretório, podendo centralizar as variáveis de ambiente e não deixá-las no projeto, ou usar o https://www.passwordstore.org/ com algum script para carregar as variáveis de ambiente quando tiver na raiz do projeto.

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