Não se trata de ser idiota ou "pagar de Mr. Robot".

Usar o Git - ou qualquer outra ferramenta - pelo terminal tem suas vantagens, principalmente em termos de produtividade. Comandos no terminal podem ser mais rápidos para tarefas simples e repetitivas, além de de ser possivel a automação através de scripts.

Além disso, você tem um maior controle sobre as operações e pode realizar tarefas avançadas que simplesmente não são possiveis atraves de uma GUI.