Cara, esse artigo é sensacional! É o tipo de conteúdo que é super difícil de achar em português, e fiquei muito feliz quando li. Recomendo demais!

Mas o título é meio enganoso. Não é que o JavaScript seja mais rápido que o C. O fato é apenas que uma versão feita sob medida para um único target, WebAssembly, acaba performando melhor que uma versão "genérica" do SQLite, que que roda em literalmente qualquer platforma!! Não tem nada a ver com o JS ser mais rápido que o C..