Na minha visão o valor está diretamente atrelado ao custo da aplicação inicialmente.
Mas depende muito, qual o formato desse seu serviço? será um sistema de mensalidade, compra única. Tudo isso irá ditar muito do seu valor final.
Em resposta a Como cobrar por um sistema?
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a ideia é aplicar o modelo SaaS, uma vez que é um processo continuo de evolucao e complexidade, onde o custo de entrada seja mais barato e consequentimente mais acessivel como o @clacerda muito bem comentou, e o custo se pagar com o tempo.