Infelizmente Java tem muito legado mas como dev .net não me arrependo nem um pouco, o ecosistema é muito bom, podendo desenvolver multiplataforma, games, IA etc.
Na minha empresa por exemplo é muito difícila achar dev .net.
O fato de Java ter mais vagas não indica que seja melhor ou pior.
Estude naquela que fique mais confortável, que goste mais, não adianta escolher uma ou outra e depois de um ano não aguentar mais olhar pra ela. Boa sorte.