Executando verificação de segurança...
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Que conta você está usando? Que privilégios ela tem?

Uma coisa confusa tanto no Windows quanto Linux e permissão de acesso.

Por exemplo, certo tempo eu descobri que a conta administrador pode não ser uma conta administrador, você tem que ativar. Não sei se isso já mudou.

Ativar
net user administrador /active:yes

Definir senha
net user administrador *

Desativar
net user administrador /active:no

Outras gambiarras
Insira o trecho de código abaixo antes do seu script bat

@echo off

:: BatchGotAdmin (Run as Admin code starts)
REM  --> Check for permissions
>nul 2>&1 "%SYSTEMROOT%\system32\cacls.exe" "%SYSTEMROOT%\system32\config\system"

REM --> If error flag set, we do not have admin.
if '%errorlevel%' NEQ '0' (
    echo Requesting administrative privileges...
    goto UACPrompt
) else ( goto gotAdmin )

:UACPrompt
    echo Set UAC = CreateObject^("Shell.Application"^) > "%temp%\getadmin.vbs"
    echo UAC.ShellExecute "%~s0", "", "", "runas", 1 >> "%temp%\getadmin.vbs"

    "%temp%\getadmin.vbs"
    exit /B

:gotAdmin
    if exist "%temp%\getadmin.vbs" ( del "%temp%\getadmin.vbs" )
    pushd "%CD%"
    CD /D "%~dp0"
:: BatchGotAdmin (Run as Admin code ends)

@echo off
:: Article: http://www.techgainer.com/create-batch-file-automatically-run-administrator
:: Your code starts from here
Echo Hello world!
pause

Uma vez tentei rodar um Powershell, veio essa porcaria de não ter permissão.
Fiz um .bat chamar, aí rodou.

Nível de administrador para programas

1) Crie um atalho na area de trabalho para o executavel

2) Vá na propreidade do atalho e adicione a seguinte linha de comando: 
runas /user:<nome_do administrador> /savecred <diretorio_programa.exe>

3) Na primeira execução do programa ele ira solicitar a senha do administrador e não ira te pertubar mais.

Exemplos
runas /user:administrador /savecred "c:\windows\programa.exe"

runas.exe /user:Wellington /savecred "G:\BKP_JOGOS\Super Nintendo\Emulador Snes9x\snes9x.exe"

Procure também por
Nível de administrador local para um usuário de domínio

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Wellington79, estou executando com a conta adm, rodei o comando para ativar, mas aparentemente já estava ativada, tentei executar meu script com o .bat acima, ele funciona quando estou debugando, mas quando crio o serviço e tento executar a mesma coisa, ele não roda, acredito que seja algo dos serviços do windows mesmo, pois quando rodo um script de criar um arquivo txt, ele cria normalmente, mas se coloco um script para reiniciar o pc, abrir um programa, ele simplesmente não faz nada, acho que não tem solução mesmo, já tentei de tudo....

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Só consigo pensar em permissões de pasta ou registro do Windows.
Se mexe com alguma pasta, dá controle para Todos de leitura e escrita.
Se mexe com alguma chave de registro do Windows faça a mesma coisa dê permissão para Todos.
Só consigo pensar nisso por hora.

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Olhando mais a fundo, encontrei esse erro aqui no visualizador de eventos do Windows:

As configurações de permissão específico do aplicativo 
não concedem permissão Local Ativação para o aplicativo de Servidor COM com CLSID 
{6B3B8D23-FA8D-40B9-8DBD-B950333E2C52}
 e APPID 
{4839DDB7-58C2-48F5-8283-E1D1807D0D7D}
 ao usuário AUTORIDADE NT\SERVIÇO LOCAL SID (S-1-5-19) do endereço 
 LocalHost (Usando LRPC) que está sendo executado no contêiner de aplicativos Não Disponível SID (Não Disponível). Essa permissão de segurança pode ser modificada com a ferramenta administrativa Serviços de Componentes.

Busquei algumas soluções, e elas dizem para alterar as permissões no registro do windows usando o APPID e CLSID fornecidos, e depois alterar permissões no menu "Serviços de Componente", mas o problema, que toda vez que tento rodar o script, o APPID e o CLSID mudam.