Vou direto ao ponto.Levando em consideração somente o seu objetivo(resumos e materiais de estudo),vai de Obsidian.Lembrando,você também pode usar as duas ferramentas,não precisa abdicar de uma para usar a outra.Defina o objetivo para cada ferramenta dentro do seu sistema de organização.Por exemplo:Notion/Gerenciamento de tarefas e Obsidian/Estudo ou Notion/Banco de Dados e Obsidian/Workflow.
Sei que o ideal seria tudo numa mesma ferramenta,mas até vc conseguir isso,vai levar um tempo.