Esse é um bug que acabei gerando sem querer em algumas modificações no SEO. Eu estarei consertando o botão de alternas os modos.

E seria também interessante usar alguma forma de armazenar a preferência no navegador.

Eu armazeno no localStorage a preferência do modo, então quando o usuário entrar novamente no site, vai estar o que ele escolheu.

Ficou bem interessante e clean.

Valeu!