A maioria de fato utilizam, mas nem em todos os projetos. Uma empresa próximo aqui de casa, cujo eu não me recordo o nome, pois faz muito tempo que eu a visitei, disse que dependendo do projeto prefere utilizar a linguagem pura, pois tem um maior controle sobre todas as partes da aplicação.
Assim como você, fiquei intrigado, uma empresa que tem vários prasos utilizam linguagem pura? Isso não demora?
A resposta deles é que, é comum usar frameworks na maioria das vezes, mas tem projetos que necessitam de maior controle, por isso trocam a agilidade pela a segurança de ter um controle maior sobre a aplicação.