Sinceramente não sei dizer qual a consideração do mercado brasileiro em relação ao certificado (Nem o externo por sinal kkkk), mas não tem o peso de uma faculdade de ciências da computação por exemplo, na qual muitos outros conceitos e conhecimentos são abordados.

O CS50, creio eu se caracteriza mais como um curso de aperfeiçoamento, como o próprio título do curso diz, é um introdutório para ciência da computação, mas que tem uma profundidade considerável em conhecimento.

Com isso, acho válido dizer o seguinte: feito o curso, você terá uma certificação de Harvard para colocar no currículo, o que com certeza vai chamar a atenção dos recrutadores e depois disso entra em ação o seu portifólio de projetos (Github), desafios de código (Codewars?) e um pouco do seu marketing pessoal (LinkedIn) para mostrar que você pode, você conhece e que você merece!

✌️

Se falei coisas a mais do necessário, me desculpe.
Boas festas! 🎉