Minha sugestão é escolher o caminho que mais rápido para desenvolver. Põe no ar e começa a gerer receita para seu negócio.

Armazenar no banco é mais rápido para desenvolver, menos código. Mais fácil de gerenciar também a segurança dos dados. Porém gasta um pouco mais de processamento, mas nada de mais.

Dica importante, esquece cobrar por espaço em disco. Escolha cobrança por nota fiscal gerada.