sempre pensei que o node_modules deveria ser uma pasta em .local contendo "todas" as libs baixadas lá e vem de uma cópia a cada projeto. E o npm, yarn, pnpm ... ou qualquer gerenciador de pacotes da vez deveria apenas apontar os módulos na pasta global.
Esse parece um projeto que segue essa ideia, então acredito ser interessante dar uma olhada