Uma dica, você pode olhar a grade curricular de cada uma pra descobrir qual te agrada mais.

Vou passar uma visão além do que já foi comentado:

Com formação em ciencia da computação, você está apto a trabalhar em todo lugar, já que o nível de profundidade dos conteúdos é alto, então, você pode ser um programador ou até mesmo pesquisador, mais pra área cientifica mesmo. Esse curso pode ter matérias mais voltadas pra matemática, por exemplo, tenho Cálculo 1 e 2, Geometria analítica, Algebra linear, fundamentos matemáticos da computação, e por ai vai (além das matérias que são voltadas a programação, tipo POO, algoritimos, estrutura de dados, IA e Machine Learning).

No curso de Sistemas da informação, você estará mais voltado pro mercado de trabalho, então, matérias de cálculo citadas anteriormente, não existem, o máximo que você encontra são algumas matérias de estatística e contas mais simples, justamente por focar no negócio, então você aprende a calcular o custo médio de uma operação, se é viavel. Seria como um curso de Adm voltado pra programação (também vai encontrar matérias tipo IA e tal, mas são bem menos). E você não está qualificado pra trabalhar em alguns cargos como quem faz CC.

Engenharia da computação eu não sei te dizer exatamente sobre, mas acho que foca na parte de construção e de como o computador funciona, analisando peças e circuitos (puramente especulação do que já ouvi um professor meu dizer).