Não tem problema, começa o quanto antes, quando você validar o produto e atingir um MRR que vale a pena tirar o CNPJ, ai sim você começa a se preocupar como empresa. Por agora válida o produto!
agora marca, é outra coisa. vai no INPI e registra tua marca! (sozinho você consegue, só da uma pesquisada no google e youtube)
mas, antes eu validaria o produto, pra ver se vale todo esse esforço de registro de marca e CNPJ.