Meus 2 cents expandidos:

Aqui eh uma area escorregadia.

1. Voce nao tem muita pratica, entao a possibilidade do codigo sair "um tanto meia boca" eh razoavel

2. Se a empresa quiser, pode comprar/alugar este tipo de solucao no mercado

3. Ainda que seja para estudo/aprendizado, voce precisa pagar suas contas

4. Apesar de ja existir codigo de 'inspiracao', diversos pontos vao ter de ser personalizados para a escola

Junte tudo isso...

De imediato e sem refletir muito eu vejo como opcoes:

a. Ele te paga uma ajuda de custo pre-definida (p.ex. R$ 4k a R$ 6k) ao mes durante o periodo de desenvolvimento. Legal para ti, mas a empresa pode acabar gastando bem acima quando comparado a um produto de prateleira.

b. Voces definem em conjunto um valor hora para desenvolvimento (p.ex. R$ 90 a R$ 250) e uma determinada quantidade de horas por mes - assim voce recebe e a empresa tambem tem um expectativa maxima de investimento mes.

c. Voce cria um "mockup" (uma ideia do sistema so com telas) e apresenta para avaliacao. Se aceito, voce estima a quantidade de horas totais, segmenta por "modulos" e a empresa vai pagando conforme a entrega de cada modulo. No inicio, um valor de 20% a 30% do total estimado seria interessante como "entrada" e garantir o compromisso entre as partes. Modelo um pouco mais complexo porque voce nao tem muita experiencia e tende a calcular mal a quantidade de horas totais, assim como o tempo para criar o "mockup" - mas pelo menos a empresa sabe quanto vai investir no total.